Darmflora of darmmicrobiota is de term voor alle micro-organismen die de darm koloniseren. Bij baby's moet de darmflora zich eerst vestigen en ontwikkelen. Uit verschillende studies blijkt dat de kolonisatie van de darm al begint in de baarmoeder. Na verloop van tijd verandert de darmflora van de zuigeling. Een gezonde darmflora is een belangrijke factor voor de gezondheid. Zo spelen gezonde darmbacteriën (zoals bifidobacteriën, lactobacillen) een belangrijke rol bij bijvoorbeeld de bestrijding van ziekmakende bacteriën. Op die manier kunnen infecties worden vermeden. Daarnaast ondersteunt de darmflora de ontwikkeling van het immuunsysteem, dat bij de geboorte nog onderontwikkeld is.